«طرح شفافیت آرا به تصویب نرسید»؛ باورش برای حامیان این مجلس سخت بود اما این جمله‌ای بود که محمدباقر قالیباف از بلندگوی مجلس اعلام کرد تا یکی دیگر از شعارهای انتخاباتی این مجلس بازهم به سرانجام نرسد. اعتراف نمایندگان مجلس یازدهم به پوپولیست بودن و اقدامات نمایشی در مجلس یازدهم یکی از همان موضوعاتی بود که در جریان بررسی این طرح ظهور و بروز داشت.
اکبر ترکان عضو حزب اعتدال و توسعه با بیان اینکه شرایط فعلی، شرایط سختی شده است، خاطرنشان کرد: در واقع آن سه نفری که در انتخابات ریاست جمهوری، با یکدیگر مناظره کردند در حال حاضر روسای سه قوه هستند. این وضعیت ادامه همان اقدامات مناظرات انتخابات ریاست جمهوری ۹۶ است امیدواریم که این سه نفر به فرمایش مقام معظم رهبری توجه کنند.
نقدعلی نماینده خمینی‌شهر در خصوص رد طرح شفافیت آرا نمایندگان می گوید: نکته این است که این نگرانی وجود دارد که طرح شفافیت مطرح شود، کلیات آن رای بیاورد و برگردد به کمیسیون تا پایان ۴ سال این دوره در آنجا بماند؛ به عبارتی از تصویب کلیات آن صرفا یک استفاده موقت و بهره‌برداری انتخاباتی صورت گیرد و این نگرانی جدی است
پناهیان در پیامی انتقادی اعلام کرد: مجلس با تاخیرش درباره طرح شفافیت و بدتر از آن با عدم تصویب شفافیت نشان داد از رشد سیاسی کافی برخوردار نیست.
ضرغامی در رابطه با رد طرح شفافیت آرای نمایندگان نوشت: «هرچند ادله‌ی مخالفین این طرح به نوبه خود قابل توجه و مسموع است ، ولی آثار زیانبار عدم تصویب آن به مراتب بیشتر خواهد بود.»
محمود صادقی که رییس فراکسیون شفاف‌سازی و سالم‌سازی اقتصاد و انضباط مالی در مجلس دهم بود به رد طرح شفافیت آرای نمایندگان در مجلس یازدهم واکنش نشان داد.
پس از رد طرح شفافیت آرای نمایندگان، نقدعلی نماینده خمینی شهر خطاب به رییس مجلس گفت: آقای قالیباف، این روزها گفته می‌شود که قرار است شما نامزد ریاست جمهوری شوید و برخی از اقدامات به ویژه بحث شفافیت ابزاری برای انتخابات ریاست جمهوری است که این در شأن مجلس نیست.
در حالی که پیش از آغاز کار مجلس یازدهم بسیاری از اصولگرایان بر طرح شفافیت آرا تاکید می کردند، الیاس نادران نماینده تهران در خصوص سرانجام طرح شفافیت آرای نمایندگان می گوید: این کار، کار خیلی ساده‌ای نیست برای اینکه خیلی‌ها شاید تمایل نداشته باشند که آراءشان به خصوص در مورد وزرا و رای اعتماد به آن‌ها مشخص شود!
سخنگوی هیئت رئیسه مجلس گفت: در شبهات طوری موضوع بیان شده که مجلس درصدد صدور مجوز برای نظامیان است؛ درحالی که این مجوز از ابتدای انقلاب وجود داشته و هیچ اقدام جدیدی در این باره انجام نشده است. به عنوان نمونه در اولین انتخابات ریاست جمهوری که برگزار شد یکی از دریاداران مطرح ارتش در آن زمان شرکت کرد و در ادوار بعدی نیز این رویه وجود داشته است؛ قانون اساسی در این زمینه منع نکرده است و ما هم نمی توانیم آن ها را منع کنیم.
عضو کمیسیون تدوین آئین نامه داخلی مجلس با تشریح جزئیات طرح شفافیت آرای نمایندگان، گفت: همانطور که در صحن علنی پارلمان مذاکرات شفاف است باید در رای‌گیری‌ها نیز این شفافیت وجود داشته باشد.